1. Pengembangan Perikanan Tangkap
– Pemulihan sumberdaya ikan di laut teritorial;
– Pengelolaan penangkapan ikan di laut teritorial;
– Pengelolaan pelabuhan perikanan;
– Pengurusan dokumen perizinan kapal perikanan.
2. Pengembangan Budidaya Perikanan
– Pengurusan dokumen perizinan usaha budidaya lintas Kabupaten/Kota;
– Penyediaan benih ikan dan induk ikan unggul;
– Kaji terap teknologi budidaya perikanan;
– Peningkatan produksi perikanan budidaya;
– Pengembangan usaha budidaya perikanan.
3. Pengembangan Pengolahan dan Pemasaran Hasil Perikanan
– Pengurusan dokumen perizinan usaha pengelolaan dan pemasaran lintas Kabupaten/Kota;
– Pengujian mutu produk hasil perikanan;
– Perluasan akses pasar;
– Pengembangan usaha pengolahan dan pemasaran hasil perikanan.
4. Pengelolaan Kelautan, Pesisir dan Pulau-pulau Kecil
– Penataan kawasan pengelolaan pesisir, kelautan dan pulau-pulau kecil;
– Pemberdayaan masyarakat pesisir dan pulau-pulau kecil;
– Peningkatan produksi dan produktivitas garam rakyat;
– Pemulihan kerusakan ekosistem laut dan pesisir (mangrove dan vegetasi pantai).
5. Pengawasan Pemanfaatan Sumbedaya Kelautan dan Perikanan